Специальный курс «Монастырская культура в России в XVIII – начале XX века» посвящен монастырям и монашеству в синодальный период. Автор спецкурса — заместитель заведующего кафедрой истории Церкви исторического факультета МГУ, научный редактор ЦНЦ «Православная энциклопедия», доцент, кандидат исторических наук Глеб Запальский.
Монастырская культура рассматривается автором как комплексное явление, включающее в себя духовное, просветительское, экономическое, политическое, военное, социальное, художественное, бытовое наследие монастырей и монашествующих. Курс состоит из пяти лекций и призван познакомить слушателей с источниками, историографией, типологией монастырей и монашествующих и особенностями монастырской культуры.
Свято-Филаретовский институт и кафедра церковно-исторических дисциплин стремятся расширять сотрудничество с известными специалистами в области церковной истории. В 2008/09 учебном году спецкурс «Россия и христианский Восток XVII – XX века» прочитала д.и.н. Лора Герд. В январе прошлого года студенты СФИ познакомились с курсом лекций д.и.н. Михаила Шкаровского «Проблемы истории Русской Православной Церкви». Каждая из этих лекций представляла собой отдельную тему, интересную своим содержанием и привлечением архивных источников.